両者には大変大きな違いがあります。どちらも”システム”とはいえ、同列に論じるには無理があります。比較表で整理してみます。

ERPシステムPilotシリーズ
対象業務会計処理業務支援
用語会計基準用語個別用語
性格実行系計画系・シミュレーション
対象データ確定データ予測データ・予定データ
処理パターン定型処理非定型・プロセス型処理
機能分類・集計判断・操作・提示
UI入力・出力リスト画面操作中心

両システムの性格の違いが、「Pilot検討の進め方(Try&Go方式)」の良さを示していると思われます。